中日友好医院科技中心（科研处）成立于2022年1月18日。为加强医院科研体系建设和科研工作管理，中心由科研处和中日友好临床医学研究所整合而成，为医院内设实体机构。参照职能部门目前中心下设7个机构:科技战略部、基础研究部、临床研究部、临床项目管理部、科技成果转化部、大数据研究部、综合管理部。
成立以来，中心领导带领团队创建新型科研管理体制激活医院创新活力。始终围绕切实解决临床科研的“痛点与难点”，从“给制度”“给平台”“给资金”“给人力”角度部署科技创新制度改革。在院领导支持下，构建了健全的基础研究—临床研究—成果转化医学研究体系，搭建了科研物资线上一键式、数字化采购平台，深化了科研“放管服”，建立了个人和科室的科研绩效闭环，实现了个人科研产出、学科发展及医院战略目标的共赢。
其中基础研究部与临床研究部是两个实体运行单元。2021年中日医院临床医学研究所（基础研究部）的软硬件全面转型升级，打造了5000m2的开放共享平台，分四大平台满足了各临床科室在科研空间、设备、技术支持方面的需求；所下设类器官技术平台、BXD遗传多样性小鼠平台（中国唯一授权使用单位），提供了开展高水平科研的重要资源；增设科研助理岗位，丰富科研队伍，为临研人员提供科研服务，为人才成长“松绑减负”“加油助力”。
临床研究部基于北京市研究型病房示范建设项目，打造健全的临床研究体系，辅助并协调全院临床研究的开展。通过培训、科研服务等形式为医院临床研究提供方法学和技术支撑，助力临床研究的高质量、规范化开展，培养优秀的临床研究人才，带动医院科研水平的进一步提升。具体包括：整合院内外相关临床研究和数据分析资源等，开设临床研究设计咨询门诊。培养和培训临床研究项目助理团队，提供以研究助理为主体的临床研究项目协助服务。构建并完善临床研究质量保证体系，建立临床研究质控团队，对临床研究的实施全过程进行质量监管。
近两年，医院学科实力稳步提升，我院2023年度科技量值排名（STEM）跃升至第21名，获批呼吸和共病全国重点实验室、国家中医药管理局高水平中医药重点学科建设项目9项。医院科研经费及科研产出大幅增长，与2021年相比，科研经费从1.8亿余元增长到3.8亿余元；发明专利、成果转化实现突破性增长，发明专利授权增62项，成果转化数目从1项增长到8项，金额从21,82万元增长到5594.56万元，2023年度JCR 1区论文占比增长10%。
中心主任刘丽宏，在医院领导下主持中心全面工作，负责医院科研体系建设及科研管理等各项工作，同时分管临床研究部及科技成果转化部。中心常务副主任肖诚，在中心主任领导下负责中心日常管理及科技战略部的管理。中心副主任彭亮、陈志华、左先波，在中心主任领导下根据分工履行相关管理职责，同时分别分管基础研究部、综合管理部、大数据研究部。临床项目管理部主任常宗平，负责其部门管理工作。
